Construida en 1315 (año 5075 del calendario judío), fue declarada monumento nacional en 1885, tras descubrirse un año antes la bella decoración mudéjar de sus muros, poblados de inscripciones hebreas tomadas en su mayor parte del libro de los Salmos.
La sinagoga es el monumento más visitado de Córdoba después de la Mezquita-Catedral.